1.1999年8月被衛生部、國家醫藥管理局授予“百佳醫院”稱號。

        2.2000年2月獲中國'99昆明世界園藝博覽會（1999.5.1—1999.10.31）衛生保障工作貢獻獎。

        3.2001年12月獲云南省科技事業單位檔案管理國家二級。

        4.2002年2月獲云南省衛生系統行業作風建設先進集體。

        5.2003年8月獲云南省防治非典型肺炎先進集體。

        6.2003年10月獲省級衛生系統檔案目標管理工作先進集體。

        7.2003年11月獲云南省教衛科系統民主管理、校務、院務、所務公開工作先進單位。

        8.2005年1月獲云南省衛生系統行風建設先進集體。

        9.2006年6月獲云南省防盲先進集體。

        10.2006年8月獲云南省教衛科系統民主管理、校（院、所）務公開先進集體。

        11.2006年12月獲云南省疫情報告工作先進集體。

        12.2008年4月全國醫院（衛生）文化建設先進單位。

        13.2008年6月獲云南省衛生系統抗震救災先進集體。

        14.2008年6月全國三八紅旗集體。

        15.2008年6月抗震救災醫療隊全國三八紅旗集體榮譽稱號。

        16.2008年7月中華全國總工會抗震救災先進基層工會。

        17.2008年12月全國醫院感染監測先進單位。

        18.2008年12月云南省教育衛生科研系統民主管理、校務、院務、所務公開工作先進單位。

        19.2009年4月云南省五一勞動獎狀。

        20.2009年5月全國衛生系統護理專業巾幗文明崗。

        21.2009年12云南省教育衛生科研系統先進集體。

        22.2010年11月獲云南省自強模范、扶殘助殘先進集體。

        23.2010年12月獲云南省遠程醫療應用先進單位。

        24.2011年2月獲“十一五”期間全省衛生應急工作先進集體。

        25.2011年5月獲云南省優質護理服務示范工程先進單位 。 

        26.2012年2月我院榮獲云南省教育衛生科研系統2009-2011年度民主管理、校務、院務、所務公開工作優秀單位。

        27.2012年5月我院內分泌科榮獲云南省第一批優質護理示范病房。

        28.2012年5月第二臨床醫學院榮獲昆明醫科大學2012年第七屆青年教師普通話課堂教學比賽組織獎。

        29.2012年8月我院榮獲云南省衛生系統職工體育運動協會群眾體育運動先進集體

        30.2013年7月我院馬林昆、張遠平、張鴻3位同志榮獲云南省2012年度“光明工程”先進個人。

        31.2013年7月第二臨床醫學院榮獲昆明醫科大學2013年課堂教學比賽組織獎。

        32.2013年7月我院曹貴華醫師榮獲全國援外醫療工作先進個人。

        33.2014年6月我院作品《我的2013·馬林昆：從細節入手 改善醫患關系》獲選國家衛生計生委宣傳司2013“健康中國”傳播激勵計劃優秀新聞作品。

        34.2014年8月我院楊晉輝、鄧丹琪、王劍松、張捷4位同志榮獲云南省首批云嶺名醫稱號。

        35.2014年11月我院夏秀宏同志榮獲全省中醫藥工作先進個人。

        36.2014年11月在省級衛生應急技能競賽中我院與省疾控中心組隊，榮獲團體一等獎、理論考試團體單項一等獎、知識競答團體單項一等獎、桌面推演團體單項一等獎和現場技能操作團體單項一等獎，我院急診醫學部趙群遠同志榮獲突發中毒事件應急處置個人專項三等獎。

        37.2014年11月在昆明醫科大學第二附屬醫院護理部、云南省康復醫學會聯合舉辦的“駝人杯”云南省一屆護理用品創新大賽中，我院古啟啟發明的“一次性多功能灌引袋”榮獲一等獎，急診醫學部花繼紅、神經外科劉靜及康復科張麗芬獲得二等獎，護理部袁薇、呼吸內科魯雯、干療外科毛紅梅、泌尿外科一病區王俊、急診醫學部包雪艷及玉溪市人民醫院兒童呼吸科杜曉瑩獲得三等獎,其余11個項目獲得優勝獎。